La Universidad tiene como prioridad la atención primaria de la salud de toda su población universitaria. Realiza actividades de prevención, asistencia médica y acciones de comunicación y difusión orientadas a mejorar conductas y lograr hábitos saludables que permitan mejorar la calidad de vida de la comunidad universitaria.
La UNL cuenta con un Centro de Salud que funciona en la ciudad de Santa Fe y en Esperanza y con una Obra Social.