Es el título de una charla que brindará el Dr.  Pablo Dans, de la Universidad de la República y del Instituto Pasteur de Montevideo, Uruguay. 

 

Charla: Modelado y simulaciones multiescala de ácidos nucleicos modificados

Disertante: Pablo D. Dans, profesor invitado del Grupo de Biofísica Computacional. Departamento de Ciencias Biológicas, CENUR Litoral Norte, Universidad de la República, Uruguay, y de la Unidad de Bioinformática, Instituto Pasteur de Montevideo, Uruguay.

Día, hora y lugar: lunes 6 de octubre de 2025 a las 10 h en la Sala de Conferencias de la FICH-UNL (1er Piso, Laboratorio de Hidráulica – Nave I)

Descripción de la charla
Las modificaciones químicas del ADN y el ARN, reversibles y reguladas dinámicamente, están mucho más difundidas de lo que se pensaba. Estas modificaciones desempeñan funciones clave en procesos biológicos vitales, incluyendo la regulación génica, la diferenciación celular, la determinación del sexo y las respuestas al estrés. De esta forma, introducen dos capas adicionales de control celular conocidas como epigenoma y epitranscriptoma. A su vez, los ácidos nucleicos modificados han surgido como una opción terapéutica prometedora. Más allá de las conocidas vacunas de ARN, los oligonucleótidos antisentido y los aptámeros pueden incorporar diversos ácidos nucleicos modificados para aumentar su biodisponibilidad o dirigirse a células/tejidos específicos, ofreciendo nuevas oportunidades para la industria farmacéutica.

Se presentarán cinco casos de estudio exitosos en los que se emplearon el modelado y las simulaciones multiescala centradas en ácidos nucleicos para investigar: cómo las modificaciones epitranscriptómicas regulan la actividad del ribosoma; cómo las modificaciones epigenéticas 5-metilcitosina y 5-hidroximetilcitosina en el ADN afectan la estructura de la doble hélice; cómo el genoma 3D/4D de las levaduras se ve perturbado por los efectos intrínsecos de la metilación del ADN; y cómo una nueva marca epigenética en la histona H3 se vincula con la reparación del ADN. Finalmente, se presentará modXNA, un enfoque basado en fragmentos para desarrollar una biblioteca de parámetros para el campo de fuerza AMBER, de 132.685 modificaciones de ARN y ADN, cubriendo todo el espectro de los ácidos nucleicos modificados naturales y no naturales conocidos.