Inscripciones abiertas desde el 29 de junio al 10 de julio de 2026

Para alumnos de: Bioquímica y Lic. en Biotecnología

Título: Modelado tridimensional de una probable UDP-galactosa-4-epimerasa de Euglena gracilis: Rol de su promiscuidad en la partición de nucleótidos azúcares.

Tema de la actividad:
E. gracilis es un microorganismo capaz de crecer fotosintéticamente transformando la energía solar en energía química, o crecer en oscuridad, en medios que le provean de una fuente de carbono. Puede crecer a pH extremos tolerando medioambientes contaminados con metaloides o metales pesados. Este organismo tiene la capacidad de acumular en su interior distintos compuestos bio-activos que pueden ser aprovechados para uso comercial (biomedicina, biotecnología, cosmética), como por ejemplo el paramilón. La caracterización de las enzimas que catalizan la síntesis y movilización de UDP-glucosa, son de fundamental importancia en la síntesis del polisacárido de reserva1,2 y de metabolitos pivot en el escenario metabólico en Euglena gracilis, por lo que la caracterización estructural de una probable UDP-galactosa-4-epimerasa en E. gracilis propuesta por Yoshida y colaboradores, ayudará a completar el paisaje metabólico de este organismo.

Director: A. Sergio Garay

Asistente: Sergio Guerrero

Actividades: Se propone el siguiente plan de actividades para alcanzar los objetivos planteados, algunas de las cuales se desarrollarán en forma paralela como se describe dentro del cronograma propuesto:

A) Modelar la estructura 3D de la proteína putativa derivada del transcripto parcial EggalE m.54125 identificado en el transcriptoma de Euglena gracilis, empleando para ellos diferentes modeladores ab initio (AlphaFold2, AlphaFold3).
B) Realizar la comparación estructural con enzimas homólogas cristalizadas o modeladas, con el objetivo de relevar los residuos críticos del sitio activo. Proponer mutaciones que permitan verificar los resultados observados.
C) Realizar el docking de ligandos (UDP-glucosa, UDP-galactosa, UDP-gal-nac, UDP-glc-nac) en el sitio activo estudiado, con el objetivo de proponer un modo de unión y definir los residuos activos involucrados
D) Que el estudiante emplee el gen sintético de UDP-gal-4-epimerasa de E. gracilis, incluído en el vector de expresion pET28b+, para transformar células competentes de la cepa BL21(DE3), desarrolladas en distintos medios de cultivos, a distintas temperaturas, evaluando en cada caso el rendimiento de producción de la enzima recombinante.
E) Preparación del informe final de la pasantía.

Requisitos: Materias aprobadas: Física II, Físico-Qca, Qca. Orgánica II.
Se tendrá en especial cuenta quienes hayan aprobado: Bioinformática, Modelado Molecular y E. de Biología Estructural.

Lugar donde se llevará a cabo: Área de Modelado Molecular (2do piso. Depto de Física)

Duración de la actividad: 12 meses.

Documentación solicitada: enviar a el contacto detallado más abajo un curriculum vitae y un certificado analítico actualizado.

Inscripciones abiertas desde el lunes 29/6/2026 al viernes 10/7/2027.

Fecha y lugar de la entrevista: Miércoles 15/7/2026

Contacto y correo electrónico: sgaray@fbcb.unl.edu.ar